As transcrições fonéticas de palavras que incluam os radicais cefalo- e cerebro-, disponíveis no dicionário da Academia das Ciências de Lisboa, apresentam:

— cefalorraquidiano com e mudo (o que ocorre na preposição de) na sílaba ce-;

— cerebrospinal (não existe a entrada cerebrorraquidiano): com e aberto na sílaba ce-, pelo que é de admitir que cerebrorraquidiano também se pronuncia com essa vogal na primeira sílaba.

Note que, ainda em relação a cefalorraquidiano, o mesmo dicionário regista cefalotórax com e aberto na sílaba ce, o que sugere que o radical cefalo- pode também ter e aberto mesmo quando não recebe o acento principal dos compostos eruditos (morfológicos) em que intervém.