Apesar de aparecer «baixa estima» algumas vezes com o valor de «baixa autoestima» — como, por exemplo, aqui —, o correto é autoestima (escrito sem hífen segundo o novo Acordo Ortográfico por a última vogal do primeiro elemento — auto — e a primeira vogal do segundo — estima — não serem idênticas): ter (elevada/baixa, etc.) autoestima, que, como diz a própria consulente, é estima por si próprio. O auto de autoestima é um radical e significa «referente a si próprio», como o auto de automóvel, de autocombustão, de autofagia, de autocracia, e não tem nada que ver com alto, com l, adjetivo, que significa «grande, elevado».

No entanto, pode-se falar de «baixa estima» (sem hífen) ao nos referimos à estima que alguém tem por outrem: «Ele sofre de baixa estima dentro da comunidade», ou seja, a comunidade não tem grande estima por ele, não o estima muito.